ANALISIS KERAGAMAN GEN PROLAKTIN (PRL) PADA ITIK PITALAH; ITIK LOKAL SUMATERA BARAT
DOI:
https://doi.org/10.32585/ags.v7i2(is).4359Abstract
Abstrak
Prolaktin merupakan hormon polipeptida yang disekresikan oleh kelenjar pituitary anterior dan secara spesifik kandidat gen yang mengontrol variasi jumlah produksi telur dengan reduksi biosintesis telur dalam beberapa periode mengeram. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis keragaman gen Prolaktin pada itik Pitalah. Ekstraksi yang dilakukan pada sampel darah 45 ekor itik Pitalah dengan menggunakan protocol G-spinTM Total DNA Extraction Mini Kit dari Intron Biotechnology. Selanjutnya diamplifikasi dengan menggunakan sepasang primer forward 5’- CTG CAT CTG TGG ACA TTG CT-3’ dan reverse 5’GAA GCA GGT TTG GGA GTA CG-3’ dengan target fragmen 496 bp dan disekuensing menggunakan jasa 1sr Base Singapore. Data hasil sekuensing dianalisis menggunakan Seqmen DNASTAR dan MEGA 11 dan menunjukkan 14 keragaman pada daerah ekson 4 dan parsial intron 3 dan 4 pada titik mutasi INDEL 3703A, INDEL3939A, C3974A, A4030G, A4038C, T4056C, G4061A, T4091G, T4094A, T4098C, G4102A, C4106A, A4107C dan C4154G. Keragaman gen Prolaktin bersifat polimorfik dengan frekuensi genotype tidak dalam keseimbangan Hardy-Weinberg.
Kata Kunci: Prolaktin, Itik Pitalah, Keragaman, Mutasi, Mutasi, Sekuensing
References
DAFTAR PUSTAKA
Camphel A.N, R.B Jane, M, G Lawrence. 2002. Biology Fifth Edition: England (GB): Benjamin Cummings.
Chen, C. F., Y. L. Shiue., C. J. Yen., P.C. Tang., H.C. Chang and Y.P. Lee. 2007. Laying traits and underlying transcripts, expressed in the hypothalamus and pituitary gland that were associated with egg production variability in chickens Theriogenol. 68:1305-1315.
Chorev M, L. Carmel. 2012. The function of itrons. Bioinformatics and computational Biologi. Vol 3, 1-15.
Kansaku, N., T. Ohkubo, H. Okabayashi, D. Guemene, U. Kuhnlein, D. Zadworny and K. Shimada. 2005. Cloning of duck PRL cDNA and genomic DNA. Gener Compar Endocrinol, 3A9-47.
Indriati, M. 2014. Keragaman Gen Prolaktin Ekson Empat Pada Itik Peking ItikMojosari Putih dan Itik PMP Serta Asosiasinya dengan Sifat Reproduksi. Tesis. Bogor: Institut Pertanian Bogor.
Li, H. F., W.Q. Zhue, K. W. Chen, T.J. Zhang and W.T. Song. 2009. Association of polymorphisms in the intrn 1 of duck prolactin with egg performance. Tuk J Vet Anim Sci. 33(3): 193-19.
Mackay T. F. C., D. S Falconer. 1996. Introduction to Quantitative Genetics. 4th Ed. New York: Longman.
Nei M. 1987. Molecular Evolutionery Genetics. New York (NY). Columbia University Press.
Noor R.R. 2008. Genetika Ternak.: Edisi ke-4. Jakarta. Penebar Swadaya.
Rahayu, S., S. B. Sumitro, T. Susilawati dan Soemarno. 2006. Identifikasi Polimorfisme Gen GH (Growth Hormone) Sapi Bali dengan Metode PCR-RFLP. Berkala Penelitian Hayati: 7-11.
Vasconcelles, L.P.M.K, D.T. Talhari, A.P Pareira, L.L Countinho, L.C.A Regitano. 2003. Genetic characterization of Aberdeen Angus cattle using molecular markers. Genet and Mol Biol.26:133-137.
Viljoen G.J, L.H Nel, J.R Crwther. 2005. Molecular Diagnostic PCR Handbook. Netherland (NT). Springer.
Wang, C., Z. liang., W. Yu., Feng., X. Peng., Y. Gong and S. Li. 2011. Polymorphism of the prolactin gene and its association with egg production traits in native Chineseducks. South African Journal of Animal Science, 41:63-69.
Warwick, E.J., J.M. Astuti, W. Hardjosoebroto. 1990. Pemulian Ternak, Edisi ke Empat. UGMPress, Yogyakarta.
Yunita R. 2009. Pemanfaatan variasi somaklonal dan seleksi in vitro dalam perakitan tanaman toleran cekaman abiotic. J. Litbang Pertanian. 28(4).
